La serie La Clínica se basa en lo sucedido en una clínica psiquiátrica dirigida por el Dr. Cosme Krauss (Julio Bracho), hombre astuto y perverso, donde comenzarán a desencadenarse conflictos cuando al lugar llega Elvicio (José María de Tavira), un pintor alternativo e irreverente quien ha sido secuestrado por Fernando Rivadeneyra, padre de su novia Maripili (Karla Souza), para separarlo de ella.
Entre los pacientes de La Clínica también se encuentra Doña Elsa (María Fernanda García) una mujer que después de tenerlo todo termina recluida en el psiquiátrico tras perder toda su fortuna, y ahora cree que el lugar es aquél que perdió y a todos los trata como sus sirvientes.
Es ahí donde Elvicio conocerá y quedará atrapado sentimentalmente por Lucy (Valerie Domínguez) la hermosa y conservadora enfermera que a su vez es el objeto del deseo del Dr. Krauss. Para enredar más las cosas Maripili se autoingresa con tal de estar cerca de su amado Elvicio.